Pulau Pinang mula berada di bawah penguasaan British selepas kedatangan Kapten Francis Light pada tahun 1786. Pada tahun yang sama, Pulau Pinang diambil alih daripada Sultan Kedah, diikuti dengan pengambilalihan Seberang Perai pada tahun 1800. Sebelum penubuhan rasmi Jabatan Kerja Raya (JKR) Pulau Pinang pada tahun 1872, urusan kerja awam dikendalikan oleh sebuah Jawatankuasa Penilaian, yang kemudiannya digantikan oleh Suruhanjaya Perbandaran pada tahun 1867. Penubuhan Perbandaran Pulau Pinang dan Seberang Perai pada tahun 1896 telah membawa kepada pewujudan rasmi JKR Pulau Pinang. Jurutera Residen pertama ialah Kapten J.H. Shatterthwaite, di bawah seliaan J.F.A. McNair selaku Jurutera Eksekutif Negeri-negeri Selat.

Dari segi perkembangan lokasi pentadbiran, pejabat pertama JKR Pulau Pinang telah ditempatkan di King Edward Place dari tahun 1890 hingga 1948, sebelum dipindahkan ke Lebuh Farquhar. Pada tahun 1961, pejabat ini berpindah ke Bangunan Tuanku Syed Putra dan kekal di situ sehingga sekitar tahun 1980-an. Seterusnya, pejabat JKR ditempatkan di KOMTAR sehingga Disember 2014. Bermula 15 Disember 2014 hingga kini, Ibu Pejabat JKR Pulau Pinang beroperasi di bangunan baharu yang terletak di Jalan Sungai Pinang, berhampiran pejabat-pejabat teknikal utama JKR.

Dari sudut pentadbiran, JKR Pulau Pinang dibahagikan kepada lima daerah utama, iaitu Daerah Timur Laut, Daerah Barat Daya, Seberang Perai Utara, Seberang Perai Tengah dan Seberang Perai Selatan. Secara keseluruhannya, negeri Pulau Pinang terdiri daripada dua daerah di bahagian pulau dan tiga daerah di kawasan tanah besar (Seberang Perai). Kedua-dua kawasan ini dihubungkan melalui Jambatan Pulau Pinang sepanjang 13 km, Jambatan Kedua Pulau Pinang sepanjang 24 km, serta perkhidmatan feri yang menghubungkan Butterworth dan George Town bagi pejalan kaki serta penunggang motosikal.

Keluasan keseluruhan negeri Pulau Pinang adalah sebanyak 1,030.74 kilometer persegi, merangkumi 292.45 kilometer persegi kawasan pulau dan 738.29 kilometer persegi kawasan Seberang Perai. Kesemua pejabat JKR di lima daerah tersebut berada di bawah pentadbiran Ibu Pejabat JKR Pulau Pinang yang beralamat di Jalan JKR, Sungai Pinang, 11600 George Town, Pulau Pinang.